內蒙古氨基嘧啶構成蛋白質的基本單位是氨基酸。飼料中的蛋白質必須在腸胃道經過消化,分解成小分子的游離氨基酸才能被機體吸收。因此,兔體對蛋白質的需要實際上是對氨基酸的需要。通常根據氨基酸的營養作用將其分為必需氨基酸和非必需氨基酸兩類。必需氨基酸指的是兔體必不可少的且自身不能合成或合成速度不能滿足兔體需要,必須從飼料中攝取的氨基酸。兔體需要的氨基酸約有20種,其中,必需氨基酸有11種,包括精氨酸、組氨酸、蛋氨酸、賴氨酸、蘇氨酸、纈氨酸、色氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸、甘氨酸(快速生長所需)。非必需氨基酸也是兔體需要,但兔體自身可以在組織內合成或者可由其他氨基酸轉化而獲得,無需從飼料中直接攝取即可滿足需要的氨基酸。對家兔來說,非必需氨基酸有丙氨酸、酪氨酸、胱氨酸、天門冬氨酸、谷氨酸、羥脯氨酸、脯氨酸、絲氨酸、瓜氨酸9種。所有必需氨基酸在家兔體內都有各自的生理功能,其中賴氨酸、精氨酸、蛋氨酸尤為重要。如果氨基酸不均衡,即使蛋白質總量達到要求也不能使家兔發揮較好的生產性能。例如,L-精氨酸(動物體內的氨基酸均為L-構型)不足時將導致公兔的生殖能力顯著下降。L-蛋氨酸是必需氨基酸中的含硫氨基酸,在家兔體內可形成胱氨酸,不足時兔毛的產量和質量都會下降;內蒙古氨基嘧啶L-賴氨酸是所有蛋白質中含量最少的一種堿性氨基酸,能增進食欲,促進精氨酸和鈣的吸收,促進生長發育。L-賴氨酸對于合成腦神經細胞、生殖細胞等細胞核的蛋白質及血紅蛋白的合成起著不可替代的作用。當兔體內缺乏賴氨酸時,將導致脂肪供能作用下降,影響糖類和脂肪的代謝,導致家兔生長遲緩,發育受阻。由于不同飼料原料中合成蛋白質的氨基酸種類和數量各不相同,因此,在飼養實踐中應注意多種飼料搭配,使飼料中必需氨基酸互補,也可以補充氨基酸添加劑以平衡熱糧,提高蛋白質利用率。試驗證明,在日增重35~40克的育成兔日糧中,應含有精氨酸0.6%,賴氨酸0.65%,含硫氨基酸0.61%。非必需氨基酸先由碳水化合物的代謝物或由必需氨基酸合成碳鏈,再由氨基轉移反應引入氨基生成氨基酸。非必需氨基酸對家兔的營養作用十分重要,非必需氨基酸中胱氨酸和半胱氨酸是含硫氨基酸,由于胱氨酸含有二硫基(-S-S-),半胱氨酸含有巰基(—SH),這些都是組成兔毛蛋白質的成分,兔毛中的硫大部分以胱氨酸的形式存在。
有些非必需氨基酸的供給會影響必需氨基酸的需要量,如體內的酪氨酸和半胱氨酸都屬于非必需氨基酸,它們可分別由必需氨基酸中的苯丙氨酸和蛋氨酸轉變而來,當家兔日糧中酪氨酸和半胱氨酸的供給充裕時,體內可以不必消耗苯丙氨酸和蛋氨酸轉變成這兩種非必需氨基酸,內蒙古氨基嘧啶同時苯丙氨酸和蛋氨酸的需要量也會減少。