內蒙古嘧啶合成路線簡介文獻報道的合成路線主要有如下兩條：

內蒙古嘧啶路線一（《現代農藥》第16卷第6期，p14-16）：N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺以2-氨基吡啶為起始原料，經與5-醛基嘧啶縮合，硼氫化鈉還原制得，步驟繁瑣。間三氟甲基碘苯與丙二酸二甲酯經偶聯制得2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸二甲酯，再經水解制得目標中間體2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸。該中間體再通過大離去基團三氯苯酚的引入和脫去制備三氟苯嘧啶。

路線二（《現代農藥》第16卷第6期，p14-16）：N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺和2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸二甲酯的制備與路線1中方法相同。區別在于2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸二甲酯經由取代的丙二酸二鉀鹽制得水解產物2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸，進一步制備成酰氯后，與N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺縮合制得目標物三氟苯嘧啶。

路線三：該路線是以上述兩條反應路線為基礎進行改進而得。

內蒙古嘧啶以2-氨基吡啶和5-醛基嘧啶一步合成N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺，避免了使用硼氫化鈉還原，降低了反應危險性。

2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸二甲酯的制備以間三氟甲基苯乙酸為起始原料，用金屬鈉拔氫后，與碳酸二甲酯反應，避免了偶聯反應所需要的無水、無氧環境，反應條件也比較溫和。

2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸二甲酯經水解直接制備2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸，省去了引入離去基團或者制備丙二酸二鉀鹽過程，縮短了反應步驟。

2-[3-(三氟甲基)苯基]丙二酸進一步制備成酰氯后，與N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺縮合制得目標物三氟苯嘧啶，收率31%。

綜合以上，三氟苯嘧啶的現有合成路線，從原料、反應條件、收率各方面看均不是特別適合工業化生產，其工藝的改進和仍有非常大的提升空間。

7、原藥預分析及雜質結構推斷：BioGuide通過對定制合成樣品進行分析，僅發現極少量中間體N-(5-嘧啶基)甲基-2-吡啶胺的殘留。經過與定制實驗室溝通，內蒙古嘧啶該樣品為過柱純化后的產品，故純度很高，幾乎沒有發現有價值的副產物雜質信息。